エルパソの検問所で、通行者が体に薬物を隠しているのを取締官が発見する。そんな通行者の中にはなんと子持ちの女性も含まれていた。サンディエゴの捜査官は、異動でチームを離れる前の最後の作戦として、薬物を運んでいると思われる車両を追跡し、メスの運び屋を摘発することに。ニューアークリバティー国際空港の貨物検査場では、取締官が薬物の隠された貨物がないか検査を実施する。また、違法性のある高級品も押収する。
プエルトリコでは航空海上隊が離島と本島を結ぶフェリーの抜き打ち検査を実施。乗客が下船すると持ち主不明の荷物が6個見つかり、中からコカインの包みが大量に見つかる。JFK国際空港では取締官が内部情報に基づいて貨物を検査し、模倣品たばこや偽ブランド品、価値を過少申告した金のジュエリーを押収する。南部国境の検問所では、複数の旅行者が医師の処方箋のない規制医薬品を持ち込もうとして発覚。処分を受けることに。
メキシコから青果を運ぶ車両が頻繁に通過するテキサス州ファー検問所。取り締まりチームは、1台のトラックが積んでいる青唐辛子のコンテナから、巧妙に隠された麻薬を大量に発見する。一方、マイアミ捜査局では、輸出用電子機器に隠された銃パーツを押収。密輸ルート解明のため、泳がせ捜査を行うことに。また、世界一利用客の多い国際空港として知られているアトランタでは薬物や禁制品の摘発に奮闘するルーカス取締官を追う。
エルパソの税関・国境警備局は、貨車内に隠された大量のメタンフェタミンを発見。麻薬カルテルに回収される前に、迅速に警備体制を敷く。マイアミでは、国土安全保障捜査局と国務省外交保安局が偽造パスポート事件の捜査を展開。主犯格の男を逮捕したところ、共謀者は男の母親であることが判明する。ニューアーク国際空港では、税関・国境警備局の取締官が約20キロの不審な肉を発見。農産物専門家に調べてもらうことに。
ニューアーク国際空港でイギリス便の乗客に運び屋がいるとの情報が入る。調べてみると、荷物から大量の大麻が見つかる。エルパソでは姉妹のバッグに多額の未申告現金が入っているのが判明。自分の稼ぎだと主張するが、携帯電話には犯罪の証拠となる通信が残されていた。JFK国際空港では、輸入貨物に古代のものらしき彫像が見つかる。盗品の疑いがあるため、本国に返還しなくてはならない。そこで、チームが調査に乗り出す。
アメリカ国境で最も混雑するサンイシドロ検問所で探知犬がある車に反応。そしてドアの内側から大量の麻薬が見つかる。マイアミ国際空港では、取締局と捜査局が合同捜査を行う。アメリカで合法的に入手した銃を不正に輸出するケースが増えているのだ。すると、カリブ諸国向けのスピーカーに大量の銃器が隠されていた。ダレス国際空港では最近の密輸の傾向を受け、中南米から訪れる人物を中心に荷物の集中検査を実施することに。
フロリダでは、警備局と捜査局が協力し、中南米への大麻運び屋グループを摘発。また、コカインをバッテリーに隠し、密輸しようとした人物をコロンビアで拘束することに。そして、アトランタ国際空港では、国外から届いた大量の貨物から、食品医薬品局への照会を要する危険な偽造医薬品を見つけ出す。メキシコ国境の町であるエルパソでは、精鋭部隊である機動取締チームに採用されたコールマン取締官の入隊初日に密着していく。
ワシントン・ダレス国際空港では、検疫探知犬のビーグル部隊が強い絆で結ばれた取締官とタッグを組んで活躍。国内の農業を疫病や害虫から守るため、荷物に紛れた農産物や肉類などを嗅ぎ分ける。セントルイスでは国土安全保障捜査局がレイプドラッグの密売組織を摘発すべく慎重な潜入捜査を進めていた。そしてついに家宅捜索の決行日がやって来る。サンイシドロ検問所では検査した車両の珍しい場所からコカインが見つかった。